Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn1O08788 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn1O08788 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn1O08788 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dctn1O08788 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn1O08788 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms