Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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U90926O08546 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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U90926O08546 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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U90926O08546 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
U90926O08546 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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