Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MsmbO08540 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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