Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna2d1O08532 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms