Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc191J3QQ27 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms