Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm379J3QQ19 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Gm379J3QQ19 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Gm379J3QQ19 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm379J3QQ19 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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