Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim22J3QP37 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim22J3QP37 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim22J3QP37 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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