Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm20918J3QN17 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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