Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ms4a18J3QN01 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms