Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm11236J3QMS7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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