Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms