Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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