Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21863J3KMP8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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