Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E230025N22RikG5E8S3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E230025N22RikG5E8S3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms