Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r34G3XA52 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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