Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arfgef1G3X9K3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms