Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700067P10RikG3X8U2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms