Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Srp72F8VQC1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp72F8VQC1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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