Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms