Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms