Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A430078G23RikE9Q7Y4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms