Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gcnt4E9Q649 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms