Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtproE9Q612 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtproE9Q612 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms