Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip11E9Q512 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms