Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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