Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms