Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd1E9PZ26 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd1E9PZ26 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms