Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sfta2E9PXB6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Sfta2E9PXB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sfta2E9PXB6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sfta2E9PXB6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Sfta2E9PXB6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms