Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gimd1E9PW74 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms