Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syde2E9PUP1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms