Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim12cD3Z3L3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim12cD3Z3L3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms