Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms