Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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