Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms