Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Rnf217D3YYI7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf217D3YYI7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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