Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms