Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
9230113P08RikD3YWX3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9230113P08RikD3YWX3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms