Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK6

Vmn2r27, Vomeronasal 2, receptor27, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r27D3YUK6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r27D3YUK6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms