Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nxpe3B9EKK6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms