Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah3B2RWG3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms