Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap58B2RW38 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms