Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5483B2RV77 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms