Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apba1B2RUJ5 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms