Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PtprbB2RU80 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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