Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfc3h1B2RT41 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfc3h1B2RT41 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms