Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrn3B2RS91 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms