Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf1B2RRD7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms