Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Trabd2bB1ATG9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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