Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms