Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slfn8B1ARD8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms